КМАХ 2014, Том 16, номер 1 : Краткое содержание статей
Архив
16(1): 1-84

Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия
2014; Том 16 (1): 1-84


Лабораторная диагностика

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):4-9

Использование методов MALDI-TOF масс-спектрометрии и количественной ПЦР для быстрой диагностики септических состояний

Т.В. Припутневич, А.Р. Мелкумян, О.В. Бурменская, О.С. Непша, И.В. Никитина, Л.А. Любасовская, О.В. Ионов, Е.Н. Ильина, Д.Ю. Трофимов, С.Д. Митрохин

Цель исследования. Оценить возможности использования метода MALDI-TOF MS и экспериментальной тест-системы «Септи-панель», реализующей метод количественной ПЦР, при скрининге инфекционных агентов в гемокультуре.

Материал и методы. В исследование включено 50 проб крови, положительных по результатам культивирования (BactAlert, BioMerieux) 334 посевов крови от взрослых пациентов и новорождённых детей с подозрением на сепсис. Детекцию микроорганизмов проводили методами прямой масс-спектрометрии, количественной ПЦР, с использованием тест-системы «Септи-панель» и культуральным методом.

Результаты исследования. При тестировании 50 положительных гемокультур (во флаконах) методом прямой масс-спектрометрии идентифицировано до вида 76% микроорганизмов, методом количественной ПЦР — 92%. Положительный результат при одновременном использовании трёх методов был получен в 66% случаев.

Выводы. Метод MALDI-TOF MS оказался достаточно быстрым и достоверным при диагностике септических состояний, вызванных одним возбудителем. Для повышения результативности метода необходимы дальнейшие разработки методики пробоподготовки и интерпретации результатов идентифицирования в программе BioTyper. ПЦР-диагностика с применением экспериментального набора «Септи-панель» позволит в кратчайшие сроки и с высокой точностью определять широкий спектр возможных патогенов в крови. Внедрение инновационных технологий тестирования возбудителя в образцах положительных гемокультур значительно сокращает время анализа, что позволяет клиницистам принимать своевременные и обоснованные решения по терапии септицемий.

инфекции крови, прямая масс-спектрометрия, пробоподготовка, количественная ПЦР

 

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):10-17

Сравнительная оценка видовой идентификации вагинальных изолятов дрожжевых грибов методом MALDI-TOF MS и традиционными (биохимическим и фенотипическим) методами

В.В. Муравьёва, Т.В. Припутневич, М.Г. Завьялова, А.С. Анкирская, Е.Н. Ильина

Цель исследования. Сравнить результаты видовой идентификации дрожжевых грибов, выделенных из вагинального отделяемого женщин с вульвовагинальным кандидозом, традиционными микробиологическими методами и MALDI-TOF MS.

Материалы и методы. Методом MALDI-TOF MS проанализировано 2304 изолята дрожжевых грибов.

Результаты. В соответствии со значением score, свидетельствующем о точности идентификации, наилучшие результаты (score — 2–2,3) отмечены у 55,5% культур C. albicans и 67,9% не-albicans видов Candida. Один штамм (0,2%) среди не-аlbicans видов Candida, впоследствии идентифицированный методом секвенирования как Pichia fabianii, не был определён (score<1,7). Определение видовой принадлежности 1294 штаммов продублировано традиционной идентификацией. С помощью биохимического типирования идентифицировано 98,6% дрожжевых изолятов. Совпадение результатов отмечено у 1287 штаммов: у всех штаммов C. albicans и у 278 (97,5%) не-albicans видов Candida. Исключение составили 7 штаммов четырёх видов: C. nivariensis, C. lambica, C. famata и Pichia fabianii.

Выводы. Проведенное исследование показало высокую степень совпадения результатов идентификации дрожжевых грибов методом MALDI-TOF MS и традиционными методами.

вульвовагинальный кандидоз, дрожжевые грибы, масс-спектрометрия, MALDI-TOF MS, score


Болезни и возбудители

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):18-25

Выбор антимикробных препаратов при неосложнённых инфекциях мочевых путей: как принять соломоново решение?

Р.С. Козлов, А.В. Голуб

Выбор антибиотиков для терапии неосложнённых инфекций мочевых путей включает довольно широкий круг препаратов: фторхинолоны, цефалоспорины, ингибиторозащищенные бета-лактамы, аминогликозиды, карбапенемы, нитрофураны, ко-тримоксазол и фосфомицин. Относительная гетерогенность патологии (инфекции верхних и нижних отделов, степень их тяжести, частота эпизодов и т.д.), меняющаяся картина глобальной и локальной резистентности уропатогенов, новые данные относительно т.н. «параллельного ущерба» от антибиотиков, а также характеристики и доступность последних делают адекватный выбор антибиотикотерапии достаточно сложным. В статье обсуждаются критерии выбора препаратов при неосложнённых циститах и пиелонефритах в свете последних международных рекомендаций с учётом российских особенностей.

неосложнённые инфекции мочевых путей, антибиотикотерапия

 

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):26-32

Представления российских врачей об этиологии, диагностике и терапии инфекционного эндокардита

А.И. Данилов, И.В. Алексеева, Т.В. Аснер, О.Ф. Веселова, Е.Е. Власова, Е.Л. Дроздович, Ю.В. Егерь, Е.В. Елохина, А.Н. Калягин, А.В. Литвинов, В.А. Милягин, Ш.Х. Палютин, У.С. Портнягина, А.А. Рог, С.Г. Фоминых, С.П. Якупова, Д.В. Шамес, М.Г. Шпутнов

Цель. Изучить представления врачей о ведении пациентов с инфекционным эндокардитом (ИЭ).

Материалы и методы. В 2012–2013 гг. в 15 городах РФ было проведено многоцентровое исследование в форме опроса, объектом которого являлись представления врачей об этиологии, диагностике и терапии ИЭ.

Результаты. Было проанкетировано 530 респондентов. На вопрос о наиболее достоверном методе ЭхоКГ обследования только 59,4% респондентов отметили трансэзофагеальную ЭхоКГ. Большинство ответов были корректными в отношении больших (65,5%) и малых (61,3%) критериев ИЭ. Ведущим возбудителем ИЭ 40,7% респондентов отметили Staphylococcus aureus, 29,96% — Streptococcus viridians. На вопрос о наиболее типичном возбудителе ИЭ при внутривенной наркомании S. aureus назвали только 37,6% респондентов. Лишь 26,2% ответов были правильными в отношении выбора терапии ИЭ, вызванного MRSA, 32,5% — ИЭ, вызванного MSSA, 45,9, 63,2 и 26,9% — ИЭ, вызванного соответственно Enterococcus faecalis, Streptococcus viridians и Aggregatibacter actinomycetomcomitans. Количество правильных ответов по длительности антибиотикотерапии ИЭ колебалось в пределах от 40,6 до 66,1% в зависимости от обозначенного возбудителя.

Выводы. Проведённое исследование выявило ряд проблем, касающихся представлений врачей о подходах к диагностике и лечению пациентов с инфекционным эндокардитом.

инфекционный эндокардит, этиология, антибиотикотерапия, опрос


Антимикробные препараты

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):33-38

Карбапенемы в многопрофильном стационаре: некоторые клинические и экономические аспекты

Э.А. Ортенберг, Ю.Э. Шафеева, Г.И. Кирушок, Р.Л. Хохлявин, Н.П. Шень

В ретроспективном исследовании проведена оценка динамики применения (объём, номенклатура) карбапенемов за 6–летний период. 88% препаратов применялось у больных, находящихся в ОРИТ и гематологии, объём использования за изученный период вырос в 3 раза, в первую очередь — за счёт генериков меропенема, что привело к относительному снижению расходов. Повышение общего объёма использования карбапенемов и преобладание их генериков коррелировало с достоверным ростом резистентности к ним А. baumannii и тенденцией к повышению атрибутивной летальности в ОРИТ Ожогового центра.

карбапенемы, генерики, резистентность, затраты


Антибиотикорезистентность

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):39-56

Осложнённые внебольничные инфекции мочевых путей у взрослых пациентов в России

И.С. Палагин, М.В. Сухорукова, А.В. Дехнич, М.В. Эйдельштейн, А.В. Гринев, Т.С. Перепанова, Р.С. Козлов, Исследовательская группа «ДАРМИС»

Цель. Проанализировать структуру и антибиотикорезистентность возбудителей осложнённых внебольничных инфекций мочевых путей (оИМП) у взрослых пациентов в России.

Материалы и методы. В рамках проспективного эпидемиологического исследования «ДАРМИС» в 2010–2011 гг. исследовались штаммы, выделенные из мочи пациентов старше 18 лет обоего пола с внебольничными ИМП в 21 центре 17 городов России.

Результаты. Из всех 518 изолятов от взрослых пациентов 282 штамма (54,4%) было выделено из мочи пациентов с оИМП. Доля представителей семейства Enterobacteriaceae составила 79,8%, при этом E. coli была возбудителем оИМП у 61,4% пациентов. Показатели резистентности E. coli составили: для ампициллина — 53,2%; амоксициллина/клавуланата — 46,2%, ампициллина/сульбактама — 46,8%, пиперациллина — 47,4%, пиперациллина/тазобактама — 4,6%, цефотаксима — 13,9%, цефтазидима — 11,0%, цефиксима — 18,5%, цефтибутена — 12,1%, цефепима — 10,4%, амикацина — 0,6%, гентамицина — 11,0%, ципрофлоксацина — 27,7%, левофлоксацина — 27,1%, ко-тримоксазола — 31,8%, нитрофурантоина — 2,9%, фосфомицина — 1,7%, эртапенема — 0,6%. К меропенему и эртапенему устойчивых штаммов E. coli выявлено не было. Продукция β-лактамаз расширенного спектра была выявлена у 13,9% штаммов E. coli и у 19,6% штаммов других представителей семейства Enterobacteriaceae.

Выводы. Среди пероральных препаратов наибольшей активностью в отношении всех E. coli обладали фосфомицин, нитрофурантоин, а также фуразидин. В отношении всех представителей семейства Enterobacteriaceae среди пероральных препаратов активность против 90% и более продемонстрировал только фосфомицин. Из парентеральных препаратов наибольшую активность в отношении всех E. coli показали карбапенемы, амикацин и пиперациллин/тазобактам. Наиболее активными в отношении всех представителей семейства Enterobacteriaceae среди парентеральных антибиотиков также оказались карбапенемы.

осложнённые инфекции мочевых путей, антимикробные препараты, резистентность, эмпирическая терапия

 

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):57-69

Антибиотикорезистентность Haemophilus influenzae в России: результаты многоцентрового проспективного исследования ПеГАС

О.В. Сивая, Р.С. Козлов, О.И. Кречикова, Н.В. Иванчик, Л.К. Катосова, Л.В. Гудкова, группа исследователей проекта ПеГАС

Цель исследования. Изучить уровень и структуру резистентности штаммов Haemophilus influenzae к антимикробным препаратам в различных регионах России и оценить их динамику за период 2004–2009 гг.

Материалы и методы. В исследование включались последовательные клинические штаммы H. influenzae, выделенные в различных городах Центрального, Приволжского, Уральского и Сибирского федеральных округов России за период 2004–2009 гг. у пациентов с различными инфекциями (пневмония, острый средний отит, менингит, бактериемия, обострение ХОБЛ и др.). Определение чувствительности выделенных штаммов к 12 антимикробным препаратам проводилось методом микроразведений в бульоне в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI 2013).

Результаты. За период 2004–2009 гг. был получен 691 штамм H. influenzae. Все бета-лактамные антибиотики показали высокую активность в отношении протестированных штаммов H. influenzae. За исследованный период резистентность к амоксициллину, амоксициллину/клавуланату, цефтриаксону, цефотаксиму и цефтибутену составила 3,8, 0, 0, 0% соответственно. Также высокой активностью в отношении исследованных штаммов обладали макролиды: доля нечувствительных штаммов в 2006–2009 гг. составила 0,5% — для кларитромицина и 0 — для азитромицина. За шестилетний период не было выявлено ни одного штамма, резистентного к респираторным фторхинолонам (левофлоксацину, моксифлоксацину). Высокую активность в отношении исследованных H. influenzae проявили хлорамфеникол и тетрациклин, уровень устойчивости к данным препаратам за весь период исследования не превышал 5%. Стабильно низкая активность наблюдалась у ко-тримоксазола: доля нечувствительных штаммов составила 32,8% в 2004–2005 гг., 29,8% — в 2006–2009 гг.

Выводы. Бета-лактамы (амоксициллин, амоксициллин/клавуланат, цефтриаксон, цефотаксим, цефтибутен), макролиды, левофлоксацин и моксифлоксацин являются наиболее активными препаратами в отношении H. influenzae в России. Несмотря на высокую активность в отношении H. influenzae тетрациклина и хлорамфеникола, использование данных препаратов следует ограничить ввиду низкого профиля безопасности. Учитывая низкую активность ко-тримоксазола, данный препарат не рекомендуется использовать для эмпирическиой терапии инфекций, вызванных гемофильной палочкой.

Haemophilus influenzae, гемофила, антибиотикорезистентность


Опыт работы

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):70-77

Генотипирование изолятов Staphylococcus aureus, выделенных при вспышке эксфолиативного дерматита новорождённых

И.В. Абаев, Ю.П. Скрябин, Э.И. Печерских, И.П. Мицевич, Е.В. Мицевич, О.В. Коробова, В.А. Гриценко, Э.А. Светоч

Staphylococcus aureus известен как ведущий инфекционный агент при внутрибольничных инфекциях и самый частый возбудитель инфекций кожи и мягких тканей человека. Цель данного исследования — определение генетической структуры метициллиночувствительных изолятов S. aureus, выделенных от больных детей и носителей (медицинского персонала и посетителей) при локальной внутрибольничной вспышке эксфолиативного дерматита. Изоляты S. aureus изучали методами spa-, MLST-, coa- и agr-типирования, а также определяли наличие 11 генов токсинов. Показано, что все изоляты от больных детей идентичны и представляют собой штамм S. aureus t272 (ST121). Особенностью генома данного штамма является наличие двух генов эксфолиативных токсинов eta и etb и кассеты энтеротоксиновых генов egc. Результаты анализа структуры генома штамма S. aureus t272 (ST121) свидетельствуют о клональном родстве этого штамма с циркулирующими во Франции штаммами и о различии со штаммами, циркулирующими в Японии и Китае. Изоляты, выделенные от медицинского персонала и посетителей, были разделены на 9 генетических вариантов S. aureus. Один изолят, S. aureus t284 (ST121), относится к генетической линии, которая может вызывать стафилодермию, но в его геноме отсутствуют основные детерминанты вирулентности, ответственные за патогенез инфекции. Остальные выделенные от носителей изоляты относятся к 8 генетическим вариантам S. aureus, которые не выявляются среди штаммов, вызывающих эксфолиативный дерматит. Большинство этих изолятов относится к таким известным клонам S. aureus, как t002 (ST5), t012 (ST30) и t015 (ST45), которые характеризуются повышенной вирулентностью, высокой частотой горизонтального переноса SCCmec-кассет и генов токсинов. Все выявленные в исследовании изоляты S. aureus t012 (ST30) несут ген токсина синдрома токсического шока, часть из них несёт также ген лейкоцидина Пантона-Валентайна.

Staphylococcus aureus, эксфолиативные токсины, эксфолиативный дерматит


Информация

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(1):78-84

Роль и место современных макролидов в лечении бактериальных инфекций

Т.И. Гаращенко, Н.А. Геппе, М.А. Гомберг, В.Н. Зимина, Е.П. Карпова, Р.С. Козлов, Т.Л. Лапина, А.Ю. Овчинников, С.В. Рязанцев, В.М. Свистушкин, А.И. Синопальников

Азитромицин и кларитромицин занимают важное место в лечении внебольничных бактериальных инфекций. Они активны в отношении актуальных возбудителей инфекций дыхательных путей, ЛОР-органов, инфекций передаваемых половым путём, воспалительных заболеваний органов малого таза, инфекции H. pylori, нетуберкулёзных микобактерий. Это позволяет использовать «новые макролиды» в качестве лекарственных средств первого выбора при лечении данных инфекций в качестве монотерапии или в сочетании с бета-лактамными антибиотиками. Современные макролиды обладают важными иммуномодулирующими и противовоспалительными свойствами и характеризуются благоприятным профилем безопасности. Нежелательные явления при применении макролидов в подавляющем большинстве случаев представляют собой функциональные изменения со стороны различных органов и систем, являются обратимыми и проходят после завершения лечения макролидами.

макролиды, азитромицин, кларитромицин



ANTIBIOTIC.ru
IACMAC


Rambler's Top100
TopList
Rambler's Top100
 
© 1999-2015 МАКМАХ, НИИАХ
Дата последнего изменения: 01.07.2015